合肥工业大学Angew.Chem.Int.Ed.:无金属缓冲体系开发及新型DNA模块设计与组装


【引言】

DNA纳米自组装是当下研究的热点,它被广泛应用于生物及化学领域。传统的DNA自组装技术研究中,都是先将含有DNA结构的母链放置在TAE+Mg缓冲体系中,加热DNA样品溶液至合适温度,再缓慢降温(退火)使含有互补的碱性末端链相互结合,形成新的DNA链结构。这一过程需要高温、耗时久、同时缓冲体系中含有复杂的金属离子,因此具有一定的局限性。大部分自组装体系中有镁离子存在,它可能会给生物酶带来一些不利影响,因此我们积极去发展一种新的无金属离子存在的DNA自组装缓冲体系,顺利实现DNA高级有序结构的构建,进一步拓展DNA自组装技术的应用。

【成果简介】

今年,合肥工业大学化学与化工学院硕导李育林教授及其研究生李永飞(第一作者)与中国科学技术大学、美国普渡大学合作,相关的科研成果以题为“Universal pH-Responsive and Metal-Ion-Free Self-Assembly of DNANanostructures”发表在国际顶级期刊Angew.Chem.Int.Ed.。作者对DNA母链溶液的pH不断改变,顺利完成对纳米笼状的DNA结构自组装与拆卸过程的动态调控。这种创新型调控方法,对传统的DNA纳米自组装技术提出新挑战,它不需要事先设计DNA母链特殊结构就可实现动态控制,它顺利为DNA纳米材料的应用提供了广阔前景。

【图文导读】

图一:pH控制乙二胺体系下的DNA纳米结构自组装示意图

图二:在实验反应器中自组装的DNA二维阵列

a)6%天然聚丙烯酰胺凝胶电泳图,b)不同pH缓冲体系下的DX的AFM图像,c)在pH=7.5缓冲体系中自组装的DX二维阵列的AFM图

图三:pH可逆控制四面体结构的DNA自组装与拆卸

a)实验示意图,b)pH循环条件下的琼脂糖凝胶电泳分析组装和拆卸的凝胶图像

图四:在TAE/Mg2+缓冲器和EN缓冲体系中TET的DNase I消化酶的PAGE测定结果

【小结】作者基于乙二胺(EN)开发出一种新的非金属缓冲体系,成功打破了DNA自组装的缓冲体系必须要有金属阳离子的限制,并顺利用于DNA纳米结构自组装。这项研究成果促进了DNA纳米自组装技术发展,拓宽了成功自组装的DNA在医药及生物传感领域的应用。

文献链接:Universal pH-Responsive and Metal-Ion-Free Self-Assembly of DNA Nanostructures,Angew. Chem. Int. Ed. 2018, 57, 6892 –6895

本文由飞絮供稿,欧洲足球赛事 整理编辑。

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